Xã Thanh Khương nằm gần trung tâm huyện Thuận Thành, bên con sông cổ tên là sông Dâu, từng nối sông Hồng với sông Thái Bình. Xã có địa giới hành chính:

• Phía đông giáp xã Gia Đông, đông nam giáp xã Nguyệt Đức
• Phía tây giáp xã Trí Quả
• Phía nam giáp xã Hà Mãn
• Phía bắc giáp xã Đình Tổ.

Tỉnh lộ 282 (nay là một phần quốc lộ 17) chạy cắt ngang qua xã.